| 1988 |
『生命学への招待』
（勁草書房）
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| 1989 |
『脳死の人――生命学の視点から』
（東京書籍; 福武文庫、福武書店、1991/06; 『増補決定版 脳死の人――生命学の視点から』法藏館、2000/07）
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| 1991 |
『地球環境倫理とは何か』
（地球環境関西フォーラム）
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| 1993 |
『意識通信――ドリームナヴィゲイターの誕生』
（筑摩書房; ちくま学芸文庫、筑摩書房、2002/07）
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| 1994 |
『「ささえあい」の人間学−私たちすべてが「老人」＋「障害者」＋「末期患者」となる時代の社会原理の探究』【編著】
（森岡正博＋赤林朗＋斎藤有紀子＋佐藤雅彦＋土屋貴志）、法藏館）
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『生命観を問いなおす――エコロジーから脳死まで』
（ちくま新書、筑摩書房）
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『電脳福祉論』
（学苑社）
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| 1995 |
『男は世界を救えるか』【対談】
（森岡正博＋井上章一、筑摩書房）
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『対話――生命・科学・未来』【対談】
（森岡正博＋養老孟司、ジャストシステム; 『対論 脳と生命』ちくま学芸文庫、筑摩書房、2003/02）
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| 1996 |
『宗教なき時代を生きるために』
（法藏館）
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『現代生命論研究――国際日本文化研究センター共同研究報告』【編著】
（森岡正博＋早川聞多編、国際日本文化研究センター）
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| 1997 |
『自分と向き合う「知」の方法――考える力をどう磨くか 』
（PHP研究所; kinokopress.com、2001/02; ちくま文庫、筑摩書房、2006/05）
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| 2001 |
『生命学に何ができるか――脳死・フェミニズム・優生思想』
（勁草書房）
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『引き裂かれた生命 』
（kinokopress.com、2001/04）
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| 2002 |
『書評という快楽 』
（kinokopress.com、2002/05）
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| 2003 |
『無痛文明論』
（トランスビュー、2003/10/16）
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| 2005 |
『感じない男』
（ちくま新書、筑摩書房、2005/02/08）
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『生命学をひらく――自分と向きあう「いのち」の思想』
（トランスビュー、2005/07/10）
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